Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms