Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms