Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP1P11387 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP1P11387 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TOP1P11387 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP1P11387 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP1P11387 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP1P11387 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP1P11387 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms