Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPD1P10809 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPD1P10809 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms