Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGA3P0DJD8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms