Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC2BP0DI82 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms