Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4AP0C0L4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms