Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms