Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGAP02671 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGAP02671 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGAP02671 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FGAP02671 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms