Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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