Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TSPAN13O95857 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TSPAN13O95857 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPAN13O95857 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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