Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAPGEF3O95398 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAPGEF3O95398 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms