Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UFL1O94874 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UFL1O94874 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UFL1O94874 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UFL1O94874 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UFL1O94874 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UFL1O94874 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UFL1O94874 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UFL1O94874 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UFL1O94874 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms