Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXD2O60548 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms