Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms