Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD5O60279 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms