Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHX16O60231 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHX16O60231 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHX16O60231 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHX16O60231 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHX16O60231 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms