Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6DO43924 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6DO43924 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6DO43924 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6DO43924 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDE6DO43924 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PDE6DO43924 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PDE6DO43924 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6DO43924 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6DO43924 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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