Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA5O15230 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA5O15230 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms