Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBDO15205 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBDO15205 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBDO15205 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBDO15205 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms