Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKBIEO00221 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms