Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
J3KT08 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
J3KT08 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms