Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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