Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms