Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms