Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DXG7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
B4DXG7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DXG7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DXG7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms