Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms