Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms