Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.27■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms