Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KNCNA6PVL3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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