Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms