Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF222A6NCQ9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF222A6NCQ9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms