Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms