Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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