Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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PTPRAP18433 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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