Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RNU1-8P-201ENST00000384328 165 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL731567.1-201ENST00000435635 462 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RPSAP76-201ENST00000444599 853 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 DNAJC9-AS1-203ENST00000457758 548 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC104046.1-201ENST00000559487 406 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 CD209-208ENST00000593821 807 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MIR6505-201ENST00000617206 71 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC239859.6-201ENST00000622095 213 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SOCS6-203ENST00000582322 2625 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 FAM13A-213ENST00000509094 2762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 LINC00547-201ENST00000612438 3314 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 LRRC4C-203ENST00000528697 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 KLKB1-201ENST00000264690 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 LINC00284-202ENST00000439707 2521 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SNORA73.3-201ENST00000410213 189 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL441963.1-201ENST00000435137 792 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 IGKV1D-35-201ENST00000442736 271 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL035417.1-201ENST00000442754 214 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC126773.1-201ENST00000569654 547 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ESCO2-201ENST00000305188 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AASS-203ENST00000417368 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC138409.1-201ENST00000505001 3598 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 CYP4A11-203ENST00000371905 1725 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MAP3K8-202ENST00000375321 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 GALNT15-206ENST00000617544 2775 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CACNB1Q02641 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms