Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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CIPCQ9C0C6 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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CIPCQ9C0C6 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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