Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC96Q2M329 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC96Q2M329 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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