Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms