Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGEB17-201ENST00000400003 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ERVMER34-1-201ENST00000440542 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DZIP1-202ENST00000361156 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSBG1-201ENST00000258873 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFAF3-201ENST00000326912 705 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV3D-20-201ENST00000390270 445 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC074389.2-201ENST00000421380 437 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157395.1-201ENST00000427630 438 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RTN2-203ENST00000430715 1127 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHCHD4P4-201ENST00000437690 327 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LRTOMT-208ENST00000439209 801 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL26P-201ENST00000460792 307 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LSP1P2-201ENST00000479042 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV3-20-201ENST00000492167 400 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL317P-201ENST00000497408 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390726.2-201ENST00000504791 343 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01341-205ENST00000509202 503 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02106-202ENST00000513880 225 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091163.2-201ENST00000519032 460 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108471.2-202ENST00000529094 498 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IFITM9P-201ENST00000535743 396 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079602.2-201ENST00000538389 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BEST3-210ENST00000551160 721 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026954.3-201ENST00000572417 421 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL408P-201ENST00000577207 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf62-206ENST00000577436 1079 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKE-202ENST00000579827 678 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf54-209ENST00000598485 553 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591926.2-201ENST00000611780 500 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.171-201ENST00000614579 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002383.6-201ENST00000616726 697 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK10-221ENST00000617879 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00339-213ENST00000642137 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC14-201ENST00000310351 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RABGAP1-202ENST00000373647 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100827.4-201ENST00000563464 2441 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP5L-208ENST00000497029 3036 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DKK2-201ENST00000285311 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.2 ms