Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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MKRN4PQ13434 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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