Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAMC1P11047 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMC1P11047 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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