Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCOF1Q13428 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms