Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005323.1-202ENST00000581947 578 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL411P-201ENST00000585204 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006504.5-205ENST00000588318 432 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 FXYD3-205ENST00000603449 573 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009502.1-202ENST00000606673 602 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC105020.5-201ENST00000614810 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR8078-201ENST00000619811 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE1-203ENST00000553891 3244 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL445933.1-201ENST00000434240 2242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC80-202ENST00000439685 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LYPD4-203ENST00000609812 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 XDH-201ENST00000379416 5688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PPIP5K1-205ENST00000381879 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC18A1-205ENST00000440926 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ANO7-201ENST00000274979 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0907-202ENST00000368320 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00838-201ENST00000562956 2936 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 FRMPD1-202ENST00000377765 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SCN5A-203ENST00000413689 8504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MOBP-202ENST00000383754 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ELP4-210ENST00000638482 3084 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKA-229ENST00000551156 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF180-211ENST00000592529 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 HLA-V-203ENST00000457107 4814 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 FRMD6-201ENST00000344768 2972 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB34-201ENST00000319119 6564 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC6A12-203ENST00000424061 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 CAB39L-212ENST00000610540 3692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MASP1-202ENST00000296280 4015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-9Q9BYP9 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.4 ms