Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SRSF5Q13243 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms