Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 PLEKHA3-201ENST00000234453 13880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 GFOD1-202ENST00000379284 8061 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ZC3H6-201ENST00000343936 11539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RYR3Q15413 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms