Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms