Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms