Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD54BQ9Y620 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms