Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SNX13Q9Y5W8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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